O Auto Sistema possui um menu específico para a segurança das informações. Nesse menu podem ser incluidos, alterados e excluídos usuários, reorganizados cadastros, efetuar e restaurar cópias de segurança (backup). Veja ao lado as telas do backup, onde pode ser escolhido o destino para onde quer se enviar o arquivo de segurança, como disquete, CD ou outro nó da rede, por exemplo. Do mesmo modo pode-se fazer a restauração de um backup a partir de qualquer lugar onde este tenha sido salvo.
Essa é uma caracteristica muito importante do Auto Sistema, pois caso haja algum problema com o disco rígido, basta reinstalá-lo e recuperar o último backup.